Forum für Wissenschaft, Industrie und Wirtschaft

Hauptsponsoren:     3M 
Datenbankrecherche:

 

ATTO-TEC® GenePin®

10.10.2001


High-sensitivity detection methods are increasingly important in many fields, such as early-stage diagnostic of a viral or bacterial infection, environmental studies, health care, and basic physical and biochemical research. For DNA detection most methods use the polymerase chain reaction (PCR) to increase the concentration of target sequence prior to analysis. In order to determine the presence of a specific DNA sequence it is necessary to hybridize fluorescently labeled oligonucleotide probes and immobilize the hybrids on a solid surface. After removal of the unhybridized probes by a washing step the remaining fluorescence intensity is measured. The requirement that unhybridized probe molecules have to be removed precludes the use of this technique for on-line monitoring of hybridization. In addition, the physical separation of unhybridized probe molecules in a heterogeneous assay decreases the sensitivity due to nonspecific binding of probe molecules on the surface. Therefore, homogeneous assays using fluorescently labeled oligonucleotides are a desirable alternative.


ATTO-TEC® GenePin® is a DNA reporter system suited for homogeneous gene assays. It consists of individually designed oligonucleotides labeled with a dye sensitive to its molecular environment, i.e. the DNA sequence in close neighborhood. ATTO-TEC® GenePin® lights up when binding to its target sequence: as soon as the target counter strand is present, the GenePin® exhibits a strong increase in fluorescence intensity. ATTO-TEC® GenePin® is based on a molecular recognition process and balanced hybridization properties. In the absence of the target sequence GenePin® forms a stable hairpin structure which exhibits only minimal fluorescence intensity. When the target sequence is present the hairpin hybridizes spontaneously to the target thereby increasing its fluorescence intensity drastically.

Since hairpins recognize their neighboring DNA bases in close vicinity they have been called "Smart Probes"*. In contrast to double-labeled hairpin structures the synthesis of GenePins® is drastically simplified. In addition, incompletely labeled probes do not contribute to the measured signal as in case of double-labeled hairpin probes. Especially in applications that require higher identification sensitivities, photodestruction of the acceptor chromophore and subsequent increase of donor fluorescence intensity might render the unequivocal identification of hybridization events to target DNA more difficult. In contrast, unlabeled or photobleached fluorophores do not contribute to the measured signal in case of the ATTO-TEC® GenePin® concept.

In order to further increase the identification sensitivity ATTO-TEC® developed a multidimensional analysis strategy at the single molecule level. The strategy takes advantage of the fact that individual GenePins® exhibit several different characteristic after hybridization to the target sequence. Besides higher burst sizes and longer burst durations probe-target duplexes exhibit a significantly increased fluorescence decay time. This enables the efficient discrimination between closed and hybridized probe-target duplexes down to target concentrations of 10-12 M, i.e. identification of probe-target duplexes in the presence of a 200-fold excess of smart probe molecules.

* J. P. Knemeyer, N. Marmé & M. Sauer, Probes for detection of specific DNA sequences at the single-molecule level, Anal. Chem. 72 (2000) 3717.

| ATTO-TEC GmbH

Weitere Berichte zu: ATTO-TEC DNA GenePin

Weitere Nachrichten aus der Kategorie Biowissenschaften Chemie:

nachricht Polymere aus Bor produzieren
18.01.2018 | Julius-Maximilians-Universität Würzburg

nachricht Modularer Genverstärker fördert Leukämien und steuert Wirksamkeit von Chemotherapie
18.01.2018 | Deutsches Krebsforschungszentrum

Alle Nachrichten aus der Kategorie: Biowissenschaften Chemie >>>

Die aktuellsten Pressemeldungen zum Suchbegriff Innovation >>>

Die letzten 5 Focus-News des innovations-reports im Überblick:

Im Focus: Fliegen wird smarter – Kommunikationssystem LYRA im Lufthansa FlyingLab

• Prototypen-Test im Lufthansa FlyingLab
• LYRA Connect ist eine von drei ausgewählten Innovationen
• Bessere Kommunikation zwischen Kabinencrew und Passagieren

Die Zukunft des Fliegens beginnt jetzt: Mehrere Monate haben die Finalisten des Mode- und Technologiewettbewerbs „Telekom Fashion Fusion & Lufthansa FlyingLab“...

Im Focus: Ein Atom dünn: Physiker messen erstmals mechanische Eigenschaften zweidimensionaler Materialien

Die dünnsten heute herstellbaren Materialien haben eine Dicke von einem Atom. Sie zeigen völlig neue Eigenschaften und sind zweidimensional – bisher bekannte Materialien sind dreidimensional aufgebaut. Um sie herstellen und handhaben zu können, liegen sie bislang als Film auf dreidimensionalen Materialien auf. Erstmals ist es Physikern der Universität des Saarlandes um Uwe Hartmann jetzt mit Forschern vom Leibniz-Institut für Neue Materialien gelungen, die mechanischen Eigenschaften von freitragenden Membranen atomar dünner Materialien zu charakterisieren. Die Messungen erfolgten mit dem Rastertunnelmikroskop an Graphen. Ihre Ergebnisse veröffentlichen die Forscher im Fachmagazin Nanoscale.

Zweidimensionale Materialien sind erst seit wenigen Jahren bekannt. Die Wissenschaftler André Geim und Konstantin Novoselov erhielten im Jahr 2010 den...

Im Focus: Forscher entschlüsseln zentrales Reaktionsprinzip von Metalloenzymen

Sogenannte vorverspannte Zustände beschleunigen auch photochemische Reaktionen

Was ermöglicht den schnellen Transfer von Elektronen, beispielsweise in der Photosynthese? Ein interdisziplinäres Forscherteam hat die Funktionsweise wichtiger...

Im Focus: Scientists decipher key principle behind reaction of metalloenzymes

So-called pre-distorted states accelerate photochemical reactions too

What enables electrons to be transferred swiftly, for example during photosynthesis? An interdisciplinary team of researchers has worked out the details of how...

Im Focus: Erstmalige präzise Messung der effektiven Ladung eines einzelnen Moleküls

Zum ersten Mal ist es Forschenden gelungen, die effektive elektrische Ladung eines einzelnen Moleküls in Lösung präzise zu messen. Dieser fundamentale Fortschritt einer vom SNF unterstützten Professorin könnte den Weg für die Entwicklung neuartiger medizinischer Diagnosegeräte ebnen.

Die elektrische Ladung ist eine der Kerneigenschaften, mit denen Moleküle miteinander in Wechselwirkung treten. Das Leben selber wäre ohne diese Eigenschaft...

Alle Focus-News des Innovations-reports >>>

Anzeige

Anzeige

IHR
JOB & KARRIERE
SERVICE
im innovations-report
in Kooperation mit academics
Veranstaltungen

LED Produktentwicklung – Leuchten mit aktuellem Wissen

18.01.2018 | Veranstaltungen

6. Technologie- und Anwendungsdialog am 18. Januar 2018 an der TH Wildau: „Intelligente Logistik“

18.01.2018 | Veranstaltungen

DFG unterstützt Kongresse und Tagungen - März 2018

17.01.2018 | Veranstaltungen

 
VideoLinks
B2B-VideoLinks
Weitere VideoLinks >>>
Aktuelle Beiträge

Fliegen wird smarter – Kommunikationssystem LYRA im Lufthansa FlyingLab

18.01.2018 | Informationstechnologie

Optimierter Einsatz magnetischer Bauteile - Seminar „Magnettechnik Magnetwerkstoffe“

18.01.2018 | Seminare Workshops

LED Produktentwicklung – Leuchten mit aktuellem Wissen

18.01.2018 | Veranstaltungsnachrichten