Schwämme: Artenbestimmung mit genetischer Hilfe
Schwämme gehören zu den primitivsten und ältesten Tierstämmen. Sie sind weltweit verbreitet und kommen in allen Meeresgewässern und in fast allen Süßwasser-Lebensräumen vor. In vielen Ökosystemen spielen sie eine wichtige Rolle. Da Schwämme zahlreiche sekundäre Stoffwechselprodukte bilden, stehen aus Schwämmen gewonnene Substanzen auch im Fokus der Arzneimittelforschung.
Für biotechnologische Anwendungen, aber auch etwa für Biodiversitätsstudien und aus Naturschutzgründen ist es wichtig, Arten schnell und sicher bestimmen zu können. Genetische Erkennungssequenzen – sogenannte DNA-Barcodes – sind dabei ein viel versprechendes molekulares Werkzeug. Wissenschaftler um den LMU-Geobiologen Professor Gert Wörheide setzten in Zusammenarbeit mit australischen Forschern diese Methode nun erstmals für Schwämme ein.
Wertvolle Museumsstücke
Im Rahmen des internationalen „Sponge Barcoding Project“
(www.spongebarcoding.org) analysierten die Wissenschaftler mehr als 7400 Schwämme, um eine genetische Bibliothek ihrer Erkennungssequenzen zu erstellen – die zukünftig die Artenbestimmung entscheidend erleichtern könnte. „Zum Teil verwendeten wir jahrzehntealte Stücke aus dem Queensland Museum in Brisbane (Australien), was den großen Wert existierender Museumskollektionen für die Erstellung von Referenzbibliotheken zeigt“, unterstreicht Wörheide.
Die für die Studie entwickelten Methoden deckten auch potenzielle Schwierigkeiten wie etwa Kontaminationen durch fremdes Erbgut oder Verfälschungen durch sekundäre Stoffwechselprodukte auf, die nun besser angegangen werden können. (PLoS ONE vom 3. Juli 2012) göd
Publikation:
Sergio Vargas, Astrid Schuster, Katharina Sacher, Gabrielle Büttner, Simone Schätzle, Benjamin Läuchli, Kathryn Hall, John N.A. Hooper, Dirk Erpenbeck & Gert Wörheide (2012): Barcoding sponges: an overview based on comprehensive sampling. PloS ONE, 3. Juli
DOI: 10.1371/journal.pone.0039345
Kontakt:
Prof. Dr. Gert Wörheide
Lehrstuhl für Paläontologie und Geobiologie
Department für Geo- und Umweltwissenschaften
& GeoBio-CenterLMU
Ludwig-Maximilians-Universität München
Richard-Wagner-Straße 10
D-80333 München
Tel: +49 (89) 2180-6718
Fax: +49 (89) 2180-6601
E-Mail: woerheide@lmu.de
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