Forum für Wissenschaft, Industrie und Wirtschaft

Hauptsponsoren:     3M 
Datenbankrecherche:

 

Protecting Privacy in DNA Research

25.08.2009
In the last few years, genome association studies have led to breakthrough medical discoveries.

However, due to privacy concerns that the identity of individuals could be determined through DNA data, health institutes in the US and abroad removed public access to the genetic data coming from these association studies.

Such association studies have been shown to shed light on diseases such as cancer or Alzheimer’s disease, and sharing the raw data from these studies with other scientists can aid tremendously with further discoveries. For this reason, Dr. Eran Halperin of the International Computer Science Institute (ICSI) and Tel Aviv University, and colleagues at the University of California, Berkeley have developed “a mathematical formula and a software solution that ensures that malicious eyes will have very low chances to identify individuals in any study,” says Dr. Halperin.

The team found a mathematical formula to determine which SNPs -- small molecules of DNA that differ from individual to individual in the human population -- can be publicly accessed without compromising information about the participation of any individual in the study. Using software designed with this formula, NIH and other institutes can distribute important research data and make it available to scientists without compromising anyone’s privacy.

“We’ve been able to determine how much of the DNA information one can reveal, without compromising a person’s privacy,” says Halperin. “This means the substantial effort invested in collecting this data will not have been in vain. Making this data publicly available again could speed up research and allow people to make new discoveries, more quickly.”

Genome association studies compare data from many individuals to identify specific positions in the genome that may be associated with an increased risk of disease, such as cancer. For instance, Dr. Halperin was recently involved in a study that found a link between a specific genetic mutation and risk of a type of non-Hodgkin’s Lymphoma. By allowing access to genetic information from such studies to the scientific community, other scientists can leverage these studies to find more connections between genetics and diseases.

The authors of the study plan to provide access to their software to NIH, and hope that scientists will use it, thereby providing public access to their now secure collected data.

A complete list of authors:
Sriram Sankararaman and Michael Jordan of UC Berkeley
Guillaume Obozinski from Willow, a joint research team between INRIA Rocquencourt, École Normale Supérieure de Paris and Centre National de la Recherche Scientifique. (Formerly at UC Berkeley)

Eran Halperin of ICSI and Tel Aviv University

The International Computer Science Institute is a non-profit research institute located in Berkeley, California. For over 20 years, ICSI has provided a collaborative environment where prominent computer science researchers from all over the world pursue cutting edge research on a variety of computer science topics.

Leah Hitchcock | Newswise Science News
Further information:
http://www.icsi.berkeley.edu

More articles from Life Sciences:

nachricht Antibiotics: New substances break bacterial resistance
12.11.2019 | Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg

nachricht How the Zika virus can spread
11.11.2019 | Goethe-Universität Frankfurt am Main

All articles from Life Sciences >>>

The most recent press releases about innovation >>>

Die letzten 5 Focus-News des innovations-reports im Überblick:

Im Focus: A new quantum data classification protocol brings us nearer to a future 'quantum internet'

The algorithm represents a first step in the automated learning of quantum information networks

Quantum-based communication and computation technologies promise unprecedented applications, such as unconditionally secure communications, ultra-precise...

Im Focus: REANIMA - für ein neues Paradigma der Herzregeneration

Endogene Mechanismen der Geweberegeneration sind ein innovativer Forschungsansatz, um Herzmuskelschäden zu begegnen. Ihnen widmet sich das internationale REANIMA-Projekt, an dem zwölf europäische Forschungszentren beteiligt sind. Das am CNIC (Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares) in Madrid koordinierte Projekt startet im Januar 2020 und wird von der Europäischen Kommission mit 8 Millionen Euro über fünf Jahre gefördert.

Herz-Kreislauf-Erkrankungen verursachen weltweit die meisten Todesfälle. Herzinsuffizienz ist geradezu eine Epidemie, die neben der persönlichen Belastung mit...

Im Focus: Göttinger Chemiker weisen kleinstmögliche Eiskristalle nach

Temperaturabhängig gefriert Wasser zu Eis und umgekehrt. Dieser Vorgang, in der Wissenschaft als Phasenübergang bezeichnet, ist im Alltag gut bekannt. Um aber ein stabiles Gitter für Eiskristalle zu erreichen, ist eine Mindestanzahl an Molekülen nötig, ansonsten ist das Konstrukt instabil. Bisher konnte dieser Wert nur grob geschätzt werden. Einem deutsch-amerikanischen Forschungsteam unter Leitung des Chemikers Prof. Dr. Thomas Zeuch vom Institut für Physikalische Chemie der Universität Göttingen ist es nun gelungen, die Größe kleinstmöglicher Eiskristalle genau zu bestimmen. Die Forschungsergebnisse sind in der Fachzeitschrift Proceedings of the National Academy of Science erschienen.

Knapp 100 Wassermoleküle sind nötig, um einen Eiskristall in seiner kleinstmöglichen Ausprägung zu formen. Nachweisen konnten die Wissenschaftler zudem, dass...

Im Focus: Verzerrte Atome

Mit zwei Experimenten am Freie-Elektronen-Laser FLASH in Hamburg gelang es einer Forschergruppe unter Führung von Physikern des Max-Planck-Instituts für Kernphysik (MPIK) in Heidelberg, starke nichtlineare Wechselwirkungen ultrakurzer extrem-ultravioletter (XUV) Laserpulse mit Atomen und Ionen hervorzurufen. Die heftige Anregung des Elektronenpaars in einem Heliumatom konkurriert so stark mit dem ultraschnellen Zerfall des angeregten Zustands, dass vorübergehend sogar Besetzungsinversion auftreten kann. Verschiebungen der Energie elektronischer Übergänge in zweifach geladenen Neonionen beobachteten die Wissenschaftler mittels transienter Absorptionsspektroskopie (XUV-XUV Pump-Probe).

Ein internationales Team unter Leitung von Physikern des MPIK veröffentlicht seine Ergebnisse zur stark getriebenen Zwei-Elektronen-Anregung in Helium durch...

Im Focus: Distorted Atoms

In two experiments performed at the free-electron laser FLASH in Hamburg a cooperation led by physicists from the Heidelberg Max Planck Institute for Nuclear physics (MPIK) demonstrated strongly-driven nonlinear interaction of ultrashort extreme-ultraviolet (XUV) laser pulses with atoms and ions. The powerful excitation of an electron pair in helium was found to compete with the ultrafast decay, which temporarily may even lead to population inversion. Resonant transitions in doubly charged neon ions were shifted in energy, and observed by XUV-XUV pump-probe transient absorption spectroscopy.

An international team led by physicists from the MPIK reports on new results for efficient two-electron excitations in helium driven by strong and ultrashort...

Alle Focus-News des Innovations-reports >>>

Anzeige

Anzeige

VideoLinks
Industrie & Wirtschaft
Veranstaltungen

Hochleistungsmaterialien mit neuen Eigenschaften im Fokus von Partnern aus Wissenschaft und Wirtschaft

11.11.2019 | Veranstaltungen

Weniger Lärm in Innenstädten durch neue Gebäudekonzepte

08.11.2019 | Veranstaltungen

Automatisiertes Fahren und Recht

06.11.2019 | Veranstaltungen

VideoLinks
Wissenschaft & Forschung
Weitere VideoLinks im Überblick >>>
 
Aktuelle Beiträge

Effizienz-Weltrekord für organische Solarmodule aufgestellt

11.11.2019 | Energie und Elektrotechnik

Antibiotika: Neuer Wirkstoff wirkt auch bei resistenten Bakterien

11.11.2019 | Biowissenschaften Chemie

Forschungsprojekt kombiniert Digitalisierung und Verfahrenstechnik

11.11.2019 | Energie und Elektrotechnik

Weitere B2B-VideoLinks
IHR
JOB & KARRIERE
SERVICE
im innovations-report
in Kooperation mit academics