Forum für Wissenschaft, Industrie und Wirtschaft

Hauptsponsoren:     3M 
Datenbankrecherche:

 

Genome decoded: Scientists find clues to more disease resistant watermelons

27.11.2012
Are juicier, sweeter, more disease-resistant watermelons on the way? An international consortium of more than 60 scientists from the United States, China, and Europe has published the genome sequence of watermelon (Citrullus lanatus) — information that could dramatically accelerate watermelon breeding toward production of a more nutritious, tastier and more resistant fruit. The watermelon genome sequence was published in the Nov. 25 online version of the journal Nature Genetics.

The researchers discovered that a large portion of disease resistance genes were lost in the domestication of watermelon. With the high-quality watermelon sequence now complete, it is hoped that breeders can now use the information to recover some of these natural disease defenses.

The authors reported that the genome of the domesticated watermelon contained 23,440 genes, roughly the same number of genes as in humans. The group compared the genomes of 20 different watermelons and developed a first-generation genetic variation map for watermelon. This information allowed them to identify genomic regions that have been under human selection, including those associated with fruit color, taste and size.

“Watermelons are an important cash crop and among the top five most consumed fresh fruits; however, cultivated watermelons have a very narrow genetic base, which presents a major bottleneck to its breeding. Decoding the complete genome of the watermelon and resequencing watermelons from different subspecies provided a wealth of information and toolkits to facilitate research and breeding,” said Zhangjun Fei, a scientist at the Boyce Thompson Institute for Plant Research at Cornell University, and one of the leaders of this project.

Fei worked with BTI scientists on different aspects of the research, including James Giovannoni, to generate the gene expression data through RNA-sequencing and Lukas Mueller to provide additional analysis to confirm the quality of the genome assembly. Fei also collaborated with Amnon Levi, a research geneticist at the USDA-ARS, U.S. Vegetable Laboratory, Charleston, S.C., on genetic mapping and identifying candidate genes that might be useful to enhance disease resistance in watermelon. The genome sequences of the watermelon are publicly available at the Cucurbit Genomics Database (www.icugi.org), which is created and maintained by Fei’s group.

Believed to have originated in Africa, watermelons were cultivated by Egyptians more than 4,000 years ago, where the fruit was a source of water in dry, desert conditions. They are now consumed throughout the world – with over 400 varieties in global commercial production. China leads in global production of the fruit, and the United States ranks fourth with more than 40 states involved in the industry. Despite being over 90 percent water, watermelons do contain important nutrients such as vitamins A and C, and lycopene, a compound that gives some fruits and vegetables their red color and appears to reduce the risk of certain types of cancer. Watermelon is also a natural source of citrulline, a non-essential amino acid with various health and athletic performance benefits.

Contact: Bridget Rigas Garzón
Office (607) 254-2923
Mobile (607) 592-1206
bmr6@cornell.edu
or
Contact: John Carberry
Office: 607-255-5353
Mobile: 607-227-0767
johncarberry@cornell.edu

John Carberry | EurekAlert!
Further information:
http://www.cornell.edu

More articles from Life Sciences:

nachricht A new potential biomarker for cancer imaging
05.02.2016 | Universiti Putra Malaysia (UPM)

nachricht NIH researchers identify striking genomic signature shared by 5 types of cancer
05.02.2016 | NIH/National Human Genome Research Institute

All articles from Life Sciences >>>

The most recent press releases about innovation >>>

Die letzten 5 Focus-News des innovations-reports im Überblick:

Im Focus: Automatisiertes Fahren: Lenken ohne Grenzen

Projekt OmniSteer startet mit 3,4 Millionen Euro Budget, um urbane Manövrierfähigkeit von Autos zu steigern

Autos steigern die Mobilität ihrer Nutzer. In engen Innenstädten jedoch stoßen sie an die Grenzen der eigenen Manövrierfähigkeit. Etwa für Vielparker wie...

Im Focus: Automated driving: Steering without limits

OmniSteer project to increase automobiles’ urban maneuverability begins with a € 3.4 million budget

Automobiles increase the mobility of their users. However, their maneuverability is pushed to the limit by cramped inner city conditions. Those who need to...

Im Focus: Embedded World: Fraunhofer ESK zeigt Entwicklung eines ausfallsicheren Bordnetzes für die Autos der Zukunft

Hochautomatisiertes Fahren setzt voraus, dass Fahrzeuge Fehler selbstständig beheben können, bis der Fahrer in der Lage ist, selbst einzugreifen. Dazu muss im Bordnetz des Autos die Ausfallsicherheit kritischer Funktionen garantiert sein. Das Fraunhofer ESK zeigt auf der Embedded World in Nürnberg (23. bis 25. Februar), wie das mit Erweiterungen des aktuellen AUTOSAR-Standards umzusetzen ist. Hierfür stellen die ESK-Forscher auch eine Werkzeugkette vor, mit der solche Bordnetze entwickelt werden können (Halle 4 / Stand 460).

Fällt in einem hochautomatisierten Fahrzeug eine Steuerungseinheit aus, muss das Fahrzeug selbstständig reagieren, bis der Fahrer eingreifen und das Fahren...

Im Focus: Fusionsanlage Wendelstein 7-X erzeugt erstes Wasserstoff-Plasma

Bundeskanzlerin schaltet Plasma ein / Beginn des wissenschaftlichen Experimentierbetriebs

Am 3. Februar 2016 wurde in der Fusionsanlage Wendelstein 7-X im Max-Planck-Institut für Plasmaphysik (IPP) in Greifswald das erste Wasserstoff-Plasma erzeugt....

Im Focus: Mikroskopie: Neun auf einen Streich

Fortschritt für die biomedizinische Bildgebung: Im Biozentrum der Uni Würzburg wurde die Fluoreszenzmikroskopie so weiterentwickelt, dass sich jetzt bis zu neun verschiedene Zellstrukturen gleichzeitig markieren und abbilden lassen.

Mit der Fluoreszenzmikroskopie können Forscher Biomoleküle in Zellen sichtbar machen. Sie markieren die Moleküle mit fluoreszierenden Sonden, regen diese mit...

Alle Focus-News des Innovations-reports >>>

Anzeige

Anzeige

IHR
JOB & KARRIERE
SERVICE
im innovations-report
in Kooperation mit academics
Veranstaltungen

25 Jahre tropische Meeresforschung in Bremen: das Leibniz-Zentrum für Marine Tropenökologie

05.02.2016 | Veranstaltungen

Programmieren lernen leicht gemacht - GFOS lädt zum GFOS Java Summercamp

04.02.2016 | Veranstaltungen

Bochum Treff Bergmannsheil: 200 Chirurgen diskutierten aktuelle Therapien bei Protheseninfektionen

04.02.2016 | Veranstaltungen

 
B2B-VideoLinks
Weitere VideoLinks >>>
Aktuelle Beiträge

Pharmapack: Neue Verpackungslösungen von SCHOTT

05.02.2016 | Messenachrichten

Diese Zellen sagen, wo’s lang geht

05.02.2016 | Biowissenschaften Chemie

„LAVA“ kann Implantate verbessern

05.02.2016 | Materialwissenschaften